RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	RXRA	P19793	462 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	PNOC	Q13519	176 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	EXOC5	O00471	708 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CASP8	Q14790	479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IFT81	Q8WYA0	676 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	AOX1	Q06278	1338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TADA3	O75528	432 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	PSMB7	Q99436	277 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	USP21	Q9UK80	565 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624		A0A0D9SFI3	127 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ZNF213	O14771	459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	GPT	P24298	496 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	VPS16	Q9H269	839 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	PFKFB1	P16118	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	EPS15	P42566	896 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	KRT86	O43790	486 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	GCK	P35557	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TAF4B	Q92750	862 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TTC14	Q96N46	770 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	MYD88	Q99836	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	AKR1B10	O60218	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	E2F5	Q15329	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	IDE	P14735	1019 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PXN-222	ENST00000637624	VAV2	P52735	878 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms