RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 E2F4Q16254 413 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIK5Q16478 980 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 WASHC4Q2M389 1173 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 RILPL2Q969X0 211 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SPSB2Q99619 263 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 STAP2Q9UGK3 403 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CHD4Q14839 1912 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CFHP08603 1231 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5JP18859 108 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC93Q567U6 631 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF7Q92985 503 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN9AQ15858 1988 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 AK9Q5TCS8 1911 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIP5K2O43314 1243 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC4Q7Z404 712 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS37DQ86XT2 251 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 GPATCH3Q96I76 525 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CD209Q9NNX6 404 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 MED23Q9ULK4 1368 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 YDJCA8MPS7 323 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ECE2O60344 883 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD17O75943 681 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2IP78347 998 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA5Q8NB90 893 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 HAUS7Q99871 368 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 IL25Q9H293 177 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 AOX1Q06278 1338 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 SHTN1A0MZ66 631 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 F8W031 263 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ERC2O15083 957 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDX5P30044 214 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR162Q16538 588 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf34Q49A92 452 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 CERS5Q8N5B7 392 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM227BQ96M60 508 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 FSD1Q9BTV5 496 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCF2Q9UG63 623 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 DOCK2Q92608 1830 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0D9SFI3 127 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R2C6 588 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF384Q8TF68 577 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMD1Q99460 953 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 EYA3Q99504 573 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.3□□□□□ -1.24
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