RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 LIFRP42702 1097 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 PRKAB2O43741 272 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 TTLL6Q8N841 843 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 APOA5Q6Q788 366 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 C8orf76Q96K31 380 aa21.84■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 XDHP47989 1333 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SPNS3-204ENST00000575194 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 LY9Q9HBG7 655 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 PIM2Q9P1W9 311 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 ERICH2A1L162 156 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC69A6NI79 296 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 KDM4AO75164 1064 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 LAMB1P07942 1786 aa21.83■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 LTBP1Q14766 1721 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 KLRK1P26718 216 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 FOSBP53539 338 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 GPSM2P81274 684 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 OLFM4Q6UX06 510 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 TMTC2Q8N394 836 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.81■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.81■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 MECOMQ03112 1051 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 ESR2Q92731 530 aa21.8■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 STK36Q9NRP7 1315 aa21.79■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.79■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.78■■□□□ 1.08
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SPNS3-204ENST00000575194 UVSSAQ2YD98 709 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 SYT17Q9BSW7 474 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 POLLQ9UGP5 575 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-204ENST00000575194 C21orf2O43822 256 aa21.77■■□□□ 1.08
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