RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 MTFR1Q15390 333 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 ENTPD3O75355 529 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 OSBPP22059 807 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 RHBDL3P58872 404 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 TFCP2Q12800 502 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 SRRDQ9UH36 339 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLXNB2O15031 1838 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 A0A1B0GUL7 405 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 GNRH1P01148 92 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 CYP2C8P10632 490 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPRAP18433 802 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PSMC4P43686 418 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGEF6Q15052 776 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PI16Q6UXB8 463 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 XAGE2Q96GT9 111 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 CXCL11O14625 94 aa20.08■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF11Q86T75 865 aa20.08■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.08■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRMT2P55345 433 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 MECOMQ03112 1051 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 SRGAP3O43295 1099 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 BTDP43251 543 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF22Q14807 665 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 GCC1Q96CN9 775 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM27P14373 513 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCF2Q9UG63 623 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 GABRQQ9UN88 632 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRKCZQ05513 592 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYPNQ86TC9 1320 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM196BA6NMK8 535 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 BCAR3O75815 825 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCER2I3L3R5 266 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 GNAI3P08754 354 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 GRK4P32298 578 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 MCAMP43121 646 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 PICALMQ13492 652 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYH1P12882 1939 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 TBC1D12O60347 775 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA5Q8NB90 893 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL6A3P12111 3177 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 H0YGN5 161 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCL5P13501 91 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 TREML2Q5T2D2 321 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERICH6Q7L0X2 663 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 PICK1Q9NRD5 415 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 GJA8P48165 433 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 GADL1Q6ZQY3 521 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 RAET1EQ8TD07 263 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 NEUROD6Q96NK8 337 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM75PA6NK02 468 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 GJB1P08034 283 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 JAG1P78504 1218 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 POLA2Q14181 598 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLF2Q8IX21 1173 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 GNAI2P04899 355 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms