RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	RGS3	P49796	1198 aa		15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	IDI2	Q9BXS1	227 aa		15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		15.02	■□□□□ -0
RBM23-231	ENST00000557549	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ATP5J	P18859	108 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZAP70	P43403	619 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	RHBDL3	P58872	404 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	DCAF15	Q66K64	600 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	IFNL1	Q8IU54	200 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	HOOK2	Q96ED9	719 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	WRNIP1	Q96S55	665 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	CSAD	Q9Y600	493 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ENTPD3	O75355	529 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SLURP2	P0DP57	97 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	INPP5B	P32019	993 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	INHBE	P58166	350 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	PICALM	Q13492	652 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	GPATCH3	Q96I76	525 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	PTPN18	Q99952	460 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	LAMB1	P07942	1786 aa		15	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	DGKZ	Q13574	1117 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	CERS3	Q8IU89	383 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	OTUD5	Q96G74	571 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ABHD8	Q96I13	439 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	BCL11A	Q9H165	835 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	GPR25	O00155	361 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	MAP3K12	Q12852	859 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SMC5	Q8IY18	1101 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	MYH7	P12883	1935 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	BAG3	O95817	575 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ALDH1A1	P00352	501 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	PLCG2	P16885	1265 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ERO1B	Q86YB8	467 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	HAUS7	Q99871	368 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	IRF6	O14896	467 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	PPP4C	P60510	307 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	CCL15	Q16663	113 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	TEX11	Q8IYF3	940 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	14.96	□□□□□ -0.01
RBM23-231	ENST00000557549	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ERC2	O15083	957 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	GTF2A2	P52657	109 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	MAP3K10	Q02779	954 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CYP7A1	P22680	504 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PPAT	Q06203	517 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CRHR2	Q13324	411 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PPIL2	Q13356	520 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	FAM196B	A6NMK8	535 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	GOLIM4	O00461	696 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	FKTN	O75072	461 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms