RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.57□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 DISC1Q9NRI5 854 aa8.57□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 GRM2Q14416 872 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 KRT82Q9NSB4 513 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 TTLL4Q14679 1199 aa8.55□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.55□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.55□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 IGHA2P01877 340 aa8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 CD8BP10966 210 aa8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 FUT4P22083 530 aa8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 LCE1DQ5T752 114 aa8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 CSRNP1Q96S65 589 aa8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 KCNB2Q92953 911 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 VAV3Q9UKW4 847 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 LEFTY1O75610 366 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 FCGRTP55899 365 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PRKCQQ04759 706 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 U3KQE9 123 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.52□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 CD96P40200 585 aa8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PDZD3Q86UT5 571 aa8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.5□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.5□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.5□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 CEACAM5P06731 702 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 NEFMP07197 916 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 OXCT1P55809 520 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 AOC3Q16853 763 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 FAM168AQ92567 244 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ISL2Q96A47 359 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.49□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PI16Q6UXB8 463 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 SULF2Q8IWU5 870 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 GIPC2Q8TF65 315 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ASB16Q96NS5 453 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.48□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 IGSF3O75054 1194 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ARNTP27540 789 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 STK35Q8TDR2 534 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 BCO2Q9BYV7 579 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-218ENST00000552346 ITIH2P19823 946 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 VAMP1P23763 118 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 ERVK-24P63145 666 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 ZNF124Q15973 351 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 RNF214Q8ND24 703 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.46□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 MAPK1P28482 360 aa8.45□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.45□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.45□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.45□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.45□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 NME2P22392 152 aa8.44□□□□□ -1.06
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