RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 JMYQ8N9B5 988 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ZNF384Q8TF68 577 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 GPR25O00155 361 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 IL1R1P14778 569 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SPRYD7Q5W111 196 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 LTBP1Q14766 1721 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 TNNI2P48788 182 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PICK1Q9NRD5 415 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PPFIA3O75145 1194 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 HAND2P61296 217 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MTFR1Q15390 333 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MAP3K9P80192 1104 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 NCOR1O75376 2440 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SCN7AQ01118 1682 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 POTEFA5A3E0 1075 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CNGA1P29973 690 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SNAP25P60880 206 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 JAG1P78504 1218 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 ATP8B2P98198 1209 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 TNFAIP1Q13829 316 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 EFCC1Q9HA90 598 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 BTBD19C9JJ37 291 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 CYP2B6P20813 491 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 PLCD1P51178 756 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SNED1Q8TER0 1413 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 GH2P01242 217 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 FGFR2P21802 821 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 MYO7AQ13402 2215 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-212ENST00000548567 SLC10A3P09131 477 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 PSMC4P43686 418 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 MTMR2Q13614 643 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 CPXCR1Q8N123 301 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 WNK4Q96J92 1243 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 COPRSQ9NQ92 184 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 PDHXO00330 501 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 MAP2K2P36507 400 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 TREML2Q5T2D2 321 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 TEPSINQ96N21 525 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 MBD4O95243 580 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 ACER1Q8TDN7 264 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 DPF3Q92784 378 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 IFNL1Q8IU54 200 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 SPEF2Q9C093 1822 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 LCORLQ8N3X6 602 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 SP3Q02447 781 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 RNF208Q9H0X6 261 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 USP17L12C9JPN9 530 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-212ENST00000548567 USP17L21D6R901 530 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms