RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CDCA5Q96FF9 252 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ELP3Q9H9T3 547 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 WNT10BO00744 389 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 HTRA3P83110 453 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PDE4BQ07343 736 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 POTEIP0CG38 1075 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 POTEJP0CG39 1038 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MECOMQ03112 1051 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SREBF2Q12772 1141 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CAPNS2Q96L46 248 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RREB1Q92766 1687 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 UTYO14607 1347 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PSEN1P49768 467 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 NOGQ13253 232 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MTX1Q13505 466 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 IGSF3O75054 1194 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SPDYE6P0CI01 402 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CNPY4Q8N129 248 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 EVI5LQ96CN4 794 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ARMT1Q9H993 441 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SHTN1A0MZ66 631 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PLS1Q14651 629 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC96Q2M329 555 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RNF20Q5VTR2 975 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RGMBQ6NW40 437 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SLC51AQ86UW1 340 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 DCTPP1Q9H773 170 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SH2D4AQ9H788 454 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TSPY2A6NKD2 308 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 IL1R1P14778 569 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 KAZALD1Q96I82 304 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TJP1Q07157 1748 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM75PA6NK02 468 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 STX8Q9UNK0 236 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 KIF3CO14782 793 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TRPA1O75762 1119 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 GNAT2P19087 354 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K9P80192 1104 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 VPS53Q5VIR6 699 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-206ENST00000548122 TSPY8P0CW00 308 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PDE6AP16499 860 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MCAMP43121 646 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ATP5JP18859 108 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 POLA2Q14181 598 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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