RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.26■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 CETPP11597 493 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 BTDP43251 543 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ATP8B2P98198 1209 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 SNAPC2Q13487 334 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 MOGSQ13724 837 aa23.25■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 SLURP2P0DP57 97 aa23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 MAP3K10Q02779 954 aa23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 GPR108Q9NPR9 543 aa23.24■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 TNNI3KQ59H18 835 aa23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 MGAMO43451 1857 aa23.22■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.22■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 SLF2Q8IX21 1173 aa23.22■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.22■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 EFCC1Q9HA90 598 aa23.22■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 TLR2O60603 784 aa23.21■■□□□ 1.31
CTTN-211ENST00000527622 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 GORABQ5T7V8 394 aa23.2■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.19■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 PICALMQ13492 652 aa23.19■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 ARMC5Q96C12 935 aa23.19■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.19■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 CEP85Q6P2H3 762 aa23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 PANK1Q8TE04 598 aa23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.17■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 SNRKQ9NRH2 765 aa23.17■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 PTPRAP18433 802 aa23.16■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 GSTO1P78417 241 aa23.16■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.16■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 C17orf99Q6UX52 265 aa23.16■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 RAI14Q9P0K7 980 aa23.16■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 CEP290O15078 2479 aa23.16■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 POTEFA5A3E0 1075 aa23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 CXCL11O14625 94 aa23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 CTGFP29279 349 aa23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 MYH1P12882 1939 aa23.14■■□□□ 1.3
CTTN-211ENST00000527622 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 PDHXO00330 501 aa23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 TBC1D12O60347 775 aa23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 LDHCP07864 332 aa23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.14■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 FAM196BA6NMK8 535 aa23.13■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.13■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.13■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 ZAP70P43403 619 aa23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 ZNF333Q96JL9 665 aa23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 CPA4Q9UI42 421 aa23.12■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 TEX11Q8IYF3 940 aa23.11■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 PICK1Q9NRD5 415 aa23.11■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 BCRP11274 1271 aa23.1■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 PPP4CP60510 307 aa23.1■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.1■■□□□ 1.29
CTTN-211ENST00000527622 TRIM47Q96LD4 638 aa23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms