RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525762.5

TRDMT1-212, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-212ENST00000525762 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 VAV3Q9UKW4 847 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 PI16Q6UXB8 463 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 PDZD3Q86UT5 571 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 SULF2Q8IWU5 870 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 CEACAM5P06731 702 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 NEFMP07197 916 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 AOC3Q16853 763 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 ITIH2P19823 946 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 OXCT1P55809 520 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 STK35Q8TDR2 534 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 FAM168AQ92567 244 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 ISL2Q96A47 359 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 BCO2Q9BYV7 579 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 C14orf37Q86TY3 774 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDMT1-212ENST00000525762 ARNTP27540 789 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 RNF214Q8ND24 703 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 CBX8Q9HC52 389 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 DBX1A6NMT0 343 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 NME2P22392 152 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ERVK-24P63145 666 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 TMC7Q7Z402 723 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 FBLN7Q53RD9 439 aa7.44□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.44□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PKN1Q16512 942 aa7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 RETREG2Q8NC44 543 aa7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PICK1Q9NRD5 415 aa7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 CSADQ9Y600 493 aa7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PPM1JQ5JR12 505 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 KSR1Q8IVT5 923 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ARID3AQ99856 593 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.42□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 IKZF1Q13422 519 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.4□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 ASB11Q8WXH4 323 aa7.4□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRDMT1-212ENST00000525762 PDE4CQ08493 712 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 C12orf40Q86WS4 652 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 SLC38A3Q99624 504 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 SAMM50Q9Y512 469 aa7.39□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 MAPK1P28482 360 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 GSTT1P30711 240 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 NTF4P34130 210 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 PLCB3Q01970 1234 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 ZP2Q05996 745 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.38□□□□□ -1.23
TRDMT1-212ENST00000525762 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms