RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 GORABQ5T7V8 394 aa20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 PI16Q6UXB8 463 aa20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 NBPF11Q86T75 865 aa20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 SLURP2P0DP57 97 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PICALMQ13492 652 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 CXCL11O14625 94 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K10Q02779 954 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 SPATA5Q8NB90 893 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 ZNF384Q8TF68 577 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PICK1Q9NRD5 415 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 DOCK2Q92608 1830 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 GNRH1P01148 92 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 CTGFP29279 349 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 RHBDL3P58872 404 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PTPRAP18433 802 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PSMC4P43686 418 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 CENPFP49454 3210 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 LDHCP07864 332 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 MCAMP43121 646 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PRMT2P55345 433 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 GSTO1P78417 241 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 TRIM47Q96LD4 638 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 RAI14Q9P0K7 980 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 CYP2C8P10632 490 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 POLA2Q14181 598 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 SRRDQ9UH36 339 aa20.83■□□□□ 0.93
HERC3-211ENST00000513325 BCRP11274 1271 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 OSBPP22059 807 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 FAM196BA6NMK8 535 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D12O60347 775 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 HOXD10P28358 340 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 ATP8B2P98198 1209 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 TNNI3KQ59H18 835 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 SSH3Q8TE77 659 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 SNRKQ9NRH2 765 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 TRIM75PA6NK02 468 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 MIER1Q8N108 512 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 GPR108Q9NPR9 543 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 MYPNQ86TC9 1320 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 TEX11Q8IYF3 940 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 RAET1EQ8TD07 263 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 DOCK1Q14185 1865 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 FCGRTP55899 365 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 MTFR1Q15390 333 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 BRCA2P51587 3418 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 RLBP1P12271 317 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 GRK4P32298 578 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 PRKCZQ05513 592 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HERC3-211ENST00000513325 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.77■□□□□ 0.92
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