RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 RHBDL3P58872 404 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 GSTO1P78417 241 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PICALMQ13492 652 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 POLA2Q14181 598 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 C17orf99Q6UX52 265 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PI16Q6UXB8 463 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 MIER1Q8N108 512 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF384Q8TF68 577 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 GPR108Q9NPR9 543 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 CENPFP49454 3210 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 POTEFA5A3E0 1075 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDHXO00330 501 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 GNRH1P01148 92 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 ATP8B2P98198 1209 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 MOGSQ13724 837 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF11Q86T75 865 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 SSH3Q8TE77 659 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 PICK1Q9NRD5 415 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 DOCK1Q14185 1865 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC34A2O95436 690 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 MCAMP43121 646 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF333Q96JL9 665 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 RAI14Q9P0K7 980 aa22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTPRFP10586 1907 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTPRAP18433 802 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRMT2P55345 433 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 CPA4Q9UI42 421 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 TNNI3KQ59H18 835 aa22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 TBC1D12O60347 775 aa22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.04■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.03■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLURP2P0DP57 97 aa22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 PSMC4P43686 418 aa22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATP6AP1-208ENST00000484908 MGAMO43451 1857 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 RLBP1P12271 317 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 HOXD10P28358 340 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 TEX11Q8IYF3 940 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRIM47Q96LD4 638 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 SNRKQ9NRH2 765 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 SRRDQ9UH36 339 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.01■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 IGSF3O75054 1194 aa22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 BCRP11274 1271 aa22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 CTGFP29279 349 aa22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 GADL1Q6ZQY3 521 aa22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 ATAD5Q96QE3 1844 aa22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 BAG3O95817 575 aa21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 CYP2C8P10632 490 aa21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.99■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM196BA6NMK8 535 aa21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1-208ENST00000484908 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms