RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483282.1

C1orf43-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf43, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-208ENST00000483282 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CARD6Q9BX69 1037 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 RAI14Q9P0K7 980 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NID2Q14112 1375 aa9.5□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 MST1RQ04912 1400 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 PPFIA3O75145 1194 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 PLCD1P51178 756 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 STK3Q13188 491 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NNTQ13423 1086 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 SLMAPQ14BN4 828 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NCAPHQ15003 741 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CLUL1Q15846 466 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ALS2CLQ60I27 953 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CROCCP2Q86T23 111 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 TSC1Q92574 1164 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 APPBP2Q92624 585 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 L1RE1Q9UN81 338 aa9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 A0A1B0GTH6 734 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 A0A1W2PQC6 194 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 FOXO3O43524 673 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 LMAN1P49257 510 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NR1I3Q14994 352 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 POSTNQ15063 836 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 PLCB4Q15147 1175 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 SPATA20Q8TB22 786 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 DCAF5Q96JK2 942 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 IL25Q9H293 177 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CUEDC2Q9H467 287 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.48□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 A0A1B0GVL5 298 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ERICH4A6NGS2 130 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 H7C1D1 291 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CLGNO14967 610 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 KIAA0754O94854 1291 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 DEXIO95424 95 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF18P17022 549 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 15.4
C1orf43-208ENST00000483282 CORO7P57737 925 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CDK17Q00537 523 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 UBE3CQ15386 1083 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 EMBQ6PCB8 327 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF790Q6PG37 636 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 RUFY1Q96T51 708 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 MYO6Q9UM54 1294 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 NWD1Q149M9 1564 aa9.46□□□□□ -0.89
C1orf43-208ENST00000483282 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.46□□□□□ -0.9
C1orf43-208ENST00000483282 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.46□□□□□ -0.9
C1orf43-208ENST00000483282 USP27XA6NNY8 438 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms