RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482874.1

SLC22A23-208, Transcript of solute carrier family 22 member 23, human

TSL 3

Gene SLC22A23, Length 622 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC22A23-208	ENST00000482874	IGHD	P01880	384 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAP3K10	Q02779	954 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	DCAF15	Q66K64	600 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	TEX11	Q8IYF3	940 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	PDE6A	P16499	860 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	PICALM	Q13492	652 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	SPRYD7	Q5W111	196 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	FOXN1	O15353	648 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAP3K9	P80192	1104 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	CERS3	Q8IU89	383 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	MYH7	P12883	1935 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	VGLL4	Q14135	290 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	CSRNP1	Q96S65	589 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	WNK4	Q96J92	1243 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	WRNIP1	Q96S55	665 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	SIPA1L1	O43166	1804 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	ADD2	P35612	726 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	GJA5	P36382	358 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC22A23-208	ENST00000482874	FLT1	P17948	1338 aa		28.64	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		28.64	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	MX1	P20591	662 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	AIDA	Q96BJ3	306 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	ELP3	Q9H9T3	547 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	CA12	O43570	354 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	TBC1D12	O60347	775 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	TM4SF4	P48230	202 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	CSAD	Q9Y600	493 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	INPP5B	P32019	993 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	OPTN	Q96CV9	577 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	ERC2	O15083	957 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	UBE3C	Q15386	1083 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	CHGB	P05060	677 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	NUCB1	Q02818	461 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SLC22A23-208	ENST00000482874	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	MYH1	P12882	1939 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	PDE1A	P54750	535 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	SREBF2	Q12772	1141 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	ERO1B	Q86YB8	467 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	RNF186	Q9NXI6	227 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	DOCK1	Q14185	1865 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	INHBE	P58166	350 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	LCORL	Q8N3X6	602 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SLC22A23-208	ENST00000482874	OTUD5	Q96G74	571 aa		28.53	■■■□□ 2.16

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