RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477348.1

OTX1-205, Transcript of orthodenticle homeobox 1, humanhuman

TSL 3

Gene OTX1, Length 624 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1-205ENST00000477348 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
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OTX1-205ENST00000477348 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.6■■□□□ 1.21
OTX1-205ENST00000477348 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.6■■□□□ 1.21
OTX1-205ENST00000477348 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.6■■□□□ 1.21
OTX1-205ENST00000477348 BCAR3O75815 825 aa22.59■■□□□ 1.21
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OTX1-205ENST00000477348 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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OTX1-205ENST00000477348 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.47■■□□□ 1.19
OTX1-205ENST00000477348 UBXN2AP68543 259 aa22.46■■□□□ 1.19
OTX1-205ENST00000477348 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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OTX1-205ENST00000477348 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
OTX1-205ENST00000477348 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.46■■□□□ 1.19
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