RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471676.1

HUWE1-208, Transcript of HECT, UBA and WWE domain containing 1, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene HUWE1, Length 501 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HUWE1-208	ENST00000471676	ITGB2	P05107	769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	GLB1	P16278	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	CRK	P46108	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	GJA8	P48165	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	TNNI2	P48788	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	CDK8	P49336	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	ID3	Q02535	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	PAK2	Q13177	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HUWE1-208	ENST00000471676	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	DRD2	P14416	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ERVK-24	P63145	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	MPP2	Q14168	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	INPP5A	Q14642	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GFRA2	O00451	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GDF11	O95390	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	BPNT1	O95861	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	NTF4	P34130	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	RING1	Q06587	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	HDX	Q7Z353	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	NEFM	P07197	916 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	NKD1	Q969G9	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	FANCG	O15287	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GATA4	P43694	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ASPA	P45381	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SOX9	P48436	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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