RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MYH7P12883 1935 aa9.89□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 STK36Q9NRP7 1315 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MYH3P11055 1940 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SPTLC2O15270 562 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 UQCRHP07919 91 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FGFR2P21802 821 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CMA1P23946 247 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PLCB2Q00722 1185 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SYCP1Q15431 976 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CAMK4Q16566 473 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SDF4Q9BRK5 362 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ADORA1P30542 326 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 RFC4P35249 363 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A14Q15043 492 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IQCB1Q15051 598 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCDC102BQ68D86 513 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FSIP1Q8NA03 581 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 AIDAQ96BJ3 306 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 USP28Q96RU2 1077 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KCND1Q9NSA2 647 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NID2Q14112 1375 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ERICH2A1L162 156 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IKBKBO14920 756 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB43O43298 467 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZPR1O75312 459 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 MCAMP43121 646 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ6P48051 423 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.838e-42■□□□□ 10
ACTB-208ENST00000464611 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ANO1Q5XXA6 986 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 LUZP1Q86V48 1076 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SPATA5Q8NB90 893 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 GREM2Q9H772 168 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CCP110O43303 1012 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CUTAO60888 179 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 APPP05067 770 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 PDE6AP16499 860 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 KANK3Q6NY19 840 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NAPBQ9H115 298 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NARFQ9UHQ1 456 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.85□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 NUP98P52948 1817 aa9.84□□□□□ -0.83
ACTB-208ENST00000464611 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.84□□□□□ -0.83
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