RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 WRNIP1Q96S55 665 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 ELP3Q9H9T3 547 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 CSADQ9Y600 493 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 GOLIM4O00461 696 aa25.22■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 PLCG2P16885 1265 aa25.22■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 TSKSQ9UJT2 592 aa25.22■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 PPP4CP60510 307 aa25.21■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.21■■□□□ 1.63
VARS-218ENST00000459667 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 SREBF2Q12772 1141 aa25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 LAMB1P07942 1786 aa25.2■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 OPTNQ96CV9 577 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 GPATCH3Q96I76 525 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 HAUS7Q99871 368 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 RNF186Q9NXI6 227 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 GJA5P36382 358 aa25.18■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.18■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 FOCADQ5VW36 1801 aa25.18■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 TRPA1O75762 1119 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 INPP5BP32019 993 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 TM4SF4P48230 202 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 CERS3Q8IU89 383 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 PDE6AP16499 860 aa25.16■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.16■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.16■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 GCC1Q96CN9 775 aa25.16■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.15■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.15■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 OTUD5Q96G74 571 aa25.15■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 FLT1P17948 1338 aa25.14■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 INHBEP58166 350 aa25.14■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.14■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ERO1BQ86YB8 467 aa25.14■■□□□ 1.62
VARS-218ENST00000459667 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.13■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 MAP3K10Q02779 954 aa25.13■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.615e-7■■□□□ 13.4
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VARS-218ENST00000459667 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.12■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.12■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 USP5P45974 858 aa25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 IFNL1Q8IU54 200 aa25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 SIPA1L1O43166 1804 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 FAM196BA6NMK8 535 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 TBC1D12O60347 775 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 ADD2P35612 726 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 GTF2A2P52657 109 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 PPATQ06203 517 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 PPIL2Q13356 520 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 DOCK1Q14185 1865 aa25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 ALDH1A1P00352 501 aa25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 MYH1P12882 1939 aa25.09■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 IRF6O14896 467 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 ERC2O15083 957 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 MX1P20591 662 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 PALD1Q9ULE6 856 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-218ENST00000459667 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.07■■□□□ 1.6
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