RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	NBPF11	Q86T75	865 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF384	Q8TF68	577 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	CXCL11	O14625	94 aa		32.65	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	GNRH1	P01148	92 aa		32.65	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	CPA4	Q9UI42	421 aa		32.65	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		32.65	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		32.64	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		32.64	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PICALM	Q13492	652 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PI16	Q6UXB8	463 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	SPATA5	Q8NB90	893 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	DOCK2	Q92608	1830 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	RHBDL3	P58872	404 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PICK1	Q9NRD5	415 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	SLURP2	P0DP57	97 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PTPRA	P18433	802 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	CTGF	P29279	349 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PRMT2	P55345	433 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		32.59	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.59	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		32.59	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PSMC4	P43686	418 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	GSTO1	P78417	241 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
UPP1-208	ENST00000436673	LDHC	P07864	332 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	MCAM	P43121	646 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	CYP2C8	P10632	490 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	POLA2	Q14181	598 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	RAI14	Q9P0K7	980 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	SRRD	Q9UH36	339 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	TBC1D12	O60347	775 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	BCR	P11274	1271 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	OSBP	P22059	807 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	HOXD10	P28358	340 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UPP1-208	ENST00000436673	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.51	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	TNNI3K	Q59H18	835 aa		32.51	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		32.51	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		32.51	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	DOCK1	Q14185	1865 aa		32.5	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM75P	A6NK02	468 aa		32.5	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	FAM196B	A6NMK8	535 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	RAET1E	Q8TD07	263 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	MYPN	Q86TC9	1320 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	FCGRT	P55899	365 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	TEX11	Q8IYF3	940 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	SNRK	Q9NRH2	765 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		32.47	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.47	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	GRK4	P32298	578 aa		32.46	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	MIER1	Q8N108	512 aa		32.46	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	RLBP1	P12271	317 aa		32.45	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	PRKCZ	Q05513	592 aa		32.45	■■■□□ 2.79
UPP1-208	ENST00000436673	MTFR1	Q15390	333 aa		32.45	■■■□□ 2.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159 ms