RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf99	Q6UX52	265 aa		21.88	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		21.88	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	USP40	Q9NVE5	1235 aa		21.88	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		21.87	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	IDI2	Q9BXS1	227 aa		21.87	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		21.87	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR108	Q9NPR9	543 aa		21.87	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		21.87	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCF2	Q9UG63	623 aa		21.87	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YGN5	161 aa		21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TCP10	Q12799	353 aa		21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF384	Q8TF68	577 aa		21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		21.86	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DOCK2	Q92608	1830 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PI16	Q6UXB8	463 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLF2	Q8IX21	1173 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA5	Q8NB90	893 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		21.85	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXD10	P28358	340 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	INPP5B	P32019	993 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MCAM	P43121	646 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMC4	P43686	418 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SRRD	Q9UH36	339 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CPA4	Q9UI42	421 aa		21.84	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ENTPD3	O75355	529 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CTGF	P29279	349 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MECOM	Q03112	1051 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MTFR1	Q15390	333 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TNNI3K	Q59H18	835 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GORAB	Q5T7V8	394 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		21.83	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PDHX	O00330	501 aa		21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	BTD	P43251	543 aa		21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS3	P49796	1198 aa		21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM47	Q96LD4	638 aa		21.82	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP85	Q6P2H3	762 aa		21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PANK1	Q8TE04	598 aa		21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OSBP	P22059	807 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GRK4	P32298	578 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RHBDL3	P58872	404 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K10	Q02779	954 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RAET1E	Q8TD07	263 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SHISA4	Q96DD7	197 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		21.8	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MOGS	Q13724	837 aa		21.79	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DPF3	Q92784	378 aa		21.79	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		21.79	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GJB1	P08034	283 aa		21.78	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCL11	O14625	94 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	LDHC	P07864	332 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GJA8	P48165	433 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTO1	P78417	241 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		21.77	■■□□□ 1.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MYPN	Q86TC9	1320 aa		21.77	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A1	P11836	297 aa		21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL5	P13501	91 aa		21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RAI14	Q9P0K7	980 aa		21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SZT2	Q5T011	3432 aa		21.76	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BCR	P11274	1271 aa		21.75	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	UBXN2A	P68543	259 aa		21.75	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PICALM	Q13492	652 aa		21.75	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		21.75	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		21.75	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	21.75	■■□□□ 1.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF208	Q9H0X6	261 aa		21.75	■■□□□ 1.07

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