RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 PTPRAP18433 802 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 BTDP43251 543 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 RAET1EQ8TD07 263 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 ZNF384Q8TF68 577 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 SHISA4Q96DD7 197 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 IDI2Q9BXS1 227 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 MYPNQ86TC9 1320 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 FAM196BA6NMK8 535 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 CXCL11O14625 94 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 ENTPD3O75355 529 aa20.53■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 PI16Q6UXB8 463 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.53■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 H0YGN5 161 aa20.52■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 BCRP11274 1271 aa20.52■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 GRK4P32298 578 aa20.52■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 PRKCZQ05513 592 aa20.52■□□□□ 0.88
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VARS-216ENST00000428445 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.52■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 PICK1Q9NRD5 415 aa20.52■□□□□ 0.88
VARS-216ENST00000428445 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.51■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 CCL5P13501 91 aa20.5■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 18.6
VARS-216ENST00000428445 MAP3K10Q02779 954 aa20.5■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 RHBDL3P58872 404 aa20.49■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.49■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.49■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.49■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 CEP290O15078 2479 aa20.49■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.49■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.48■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 DPF3Q92784 378 aa20.48■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 DOCK1Q14185 1865 aa20.47■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.47■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.47■□□□□ 0.87
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VARS-216ENST00000428445 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 TREML2Q5T2D2 321 aa20.46■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 SLF2Q8IX21 1173 aa20.46■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.46■□□□□ 0.87
VARS-216ENST00000428445 ZBTB22O15209 634 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 GJA8P48165 433 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 FLT3LGP49771 235 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 MTX1Q13505 466 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SPATA5Q8NB90 893 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 RAI14Q9P0K7 980 aa20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 ADCY3O60266 1144 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 GJB1P08034 283 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 TRIM27P14373 513 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 GORABQ5T7V8 394 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SNRKQ9NRH2 765 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.44■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 MCAMP43121 646 aa20.43■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SPP2Q13103 211 aa20.43■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.43■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.43■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SZT2Q5T011 3432 aa20.42■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 UBXN2AP68543 259 aa20.42■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.42■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
VARS-216ENST00000428445 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.42■□□□□ 0.86
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