RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 GNPATO15228 680 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 SKILP12757 684 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO3Q9UK99 471 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 TNS2Q63HR2 1409 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.71■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 CDKL5O76039 1030 aa22.71■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 CASP1P29466 404 aa22.71■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.71■■□□□ 1.23
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TTLL3-210ENST00000427220 CNNM3Q8NE01 707 aa22.71■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.7■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.7■■□□□ 1.23
TTLL3-210ENST00000427220 SERPINC1P01008 464 aa22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 CYP2D6P10635 497 aa22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 FGFR2P21802 821 aa22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PPARAQ07869 468 aa22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 USP17L12C9JPN9 530 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 USP17L21D6R901 530 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 CTAGE5O15320 804 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 AFMP43652 599 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 NTSR2O95665 410 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB9Q96C00 473 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 LONRF3Q496Y0 759 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 USP49Q70CQ1 688 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 SHC4Q6S5L8 630 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 TNKSO95271 1327 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PRDX5P30044 214 aa22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 CFAP100Q494V2 611 aa22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 BRAPQ7Z569 592 aa22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM87BQ96K49 555 aa22.67■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.66■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ZPR1O75312 459 aa22.66■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.66■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.66■■□□□ 1.22
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TTLL3-210ENST00000427220 STX17P56962 302 aa22.66■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 SLC39A14Q15043 492 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 SETDB2Q96T68 719 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 KRT23Q9C075 422 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF174Q15697 407 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 GLI3P10071 1580 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 YEATS4O95619 227 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 PARP10Q53GL7 1025 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 FANCBQ8NB91 859 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.64■■□□□ 1.22
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.64■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 DHX58Q96C10 678 aa22.64■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 CBX1P83916 185 aa22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 NTRK3Q16288 839 aa22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 CDC25AP30304 524 aa22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 JMYQ8N9B5 988 aa22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.63■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 DPF2Q92785 391 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 NLRP3Q96P20 1036 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 TPM3P06753 285 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 ESR2Q92731 530 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 PLIN2Q99541 437 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 PRR29P0C7W0 189 aa22.61■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 EVCP57679 992 aa22.61■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 TPM4P67936 248 aa22.61■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.61■■□□□ 1.21
TTLL3-210ENST00000427220 HOMER1Q86YM7 354 aa22.61■■□□□ 1.21
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