RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MSANTD4Q8NCY6 345 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM7Q9C029 511 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GVL5 298 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFAB1O14561 156 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.439e-8■□□□□ 8.9
EFTUD2-202ENST00000426333 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.433e-6■■■□□ 15
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD50Q92878 1312 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM7P33993 719 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM169AQ9Y6X4 670 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRB2O60241 1585 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMLP26374 656 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R2P41236 205 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 OGFOD1Q8N543 542 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 LTKP29376 864 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC39A6Q13433 755 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNA2Q15822 529 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP85Q6P2H3 762 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ELP1O95163 1332 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GUA9 196 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEF1Q13905 1077 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM9Q9NXL9 1143 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF5O00463 557 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 VIMP08670 466 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RILPL1Q5EBL4 403 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RUFY3Q7L099 469 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT74Q96LB3 600 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 F8W031 263 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF22Q8N9C0 903 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP12Q02952 1782 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCG2P16885 1265 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA25Q14CX7 972 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC14Q49A88 953 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP157Q5JU67 520 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 STMN2Q93045 179 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RLBP1P12271 317 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT6Q14141 434 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SETDB2Q96T68 719 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 VWA3AA6NCI4 1184 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 A6NNZ2 444 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 VAMP4O75379 141 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PICALMQ13492 652 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB2AQ13885 445 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf74Q6P047 294 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 DPH6Q7L8W6 267 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC65Q8IXS2 484 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PLIN2Q99541 437 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB2BQ9BVA1 445 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 USP26Q9BXU7 913 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CSRNP2Q9H175 543 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 HPDP32754 393 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 B4DLN1 442 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RXRAP19793 462 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ST5P78524 1137 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CLUL1Q15846 466 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM212AQ96EL1 285 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SPOPO43791 374 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5DP30049 168 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TERF1P54274 439 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 VWA3BQ502W6 1294 aa12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms