RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 STK35Q8TDR2 534 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 C12orf49Q9H741 205 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 LGR6Q9HBX8 967 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 IRAK1P51617 712 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 FGD1P98174 961 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 TTLL4Q14679 1199 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 MSMPQ1L6U9 139 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 DISC1Q9NRI5 854 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 UNCXA6NJT0 531 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 E9PSI1 815 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ENC1O14682 589 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ADAMTS4O75173 837 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 FBXO24O75426 580 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 USP17L7P0C7H9 530 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 LRRC14Q15048 493 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 TRIM37O94972 964 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PRNPP04156 253 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 BMP6P22004 513 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 COL19A1Q14993 1142 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 MCTP1Q6DN14 999 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 PAGE1O75459 146 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-207ENST00000418674 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 GIPC2Q8TF65 315 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ISL2Q96A47 359 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 FBXL18Q96ME1 805 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 NEFMP07197 916 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 CELA3AP09093 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 SV2BQ7L1I2 683 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 CSADQ9Y600 493 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-207ENST00000418674 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PPM1JQ5JR12 505 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 FLCNQ8NFG4 579 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 AK5Q9Y6K8 562 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 FANCGO15287 622 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PAX4O43316 350 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 LMNB1P20700 586 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 RASIP1Q5U651 963 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 C12orf40Q86WS4 652 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.82□□□□□ -1.64
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