RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 MCM2P49736 904 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRC-206ENST00000413409 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRC-206ENST00000413409 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 OTOFQ9HC10 1997 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 HSPA4P34932 840 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 CCL15Q16663 113 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 IL25Q9H293 177 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 GREM2Q9H772 168 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 SPDYE6P0CI01 402 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 CFAP100Q494V2 611 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 EYA2O00167 538 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 GJA8P48165 433 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 F8W031 263 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 GTF2A2P52657 109 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 CD209Q9NNX6 404 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 CSF1RP07333 972 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRC-206ENST00000413409 GJB1P08034 283 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRC-206ENST00000413409 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 SNAP23O00161 211 aa20.44■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 HAUS7Q99871 368 aa20.44■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.44■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 MAP3K9P80192 1104 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 VCANP13611 3396 aa20.43■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 MCM4P33991 863 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRC-206ENST00000413409 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 C17orf99Q6UX52 265 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 PSMC4P43686 418 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 CUL4AQ13619 759 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.4■□□□□ 0.86
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