RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 CPVLQ9H3G5 476 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 PEAK1Q9H792 1746 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 WTAPQ15007 396 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 RGS22Q8NE09 1264 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 ANKRD7Q92527 254 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 NEDD4P46934 1319 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX13-201ENST00000409076 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CCDC66A2RUB6 948 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CYP7A1P22680 504 aa9.52□□□□□ -0.89
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SNX13-201ENST00000409076 RTN1Q16799 776 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 SHC4Q6S5L8 630 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 FAM107BQ9H098 131 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 MED23Q9ULK4 1368 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ANTXR2P58335 489 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 USP31Q70CQ4 1352 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ERBB3P21860 1342 aa9.51□□□□□ -0.89
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SNX13-201ENST00000409076 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NMT2O60551 498 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TPM1P09493 284 aa9.51□□□□□ -0.89
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SNX13-201ENST00000409076 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CBFA2T2O43439 604 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 GYG1P46976 350 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 EVX2Q03828 476 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ARID5AQ03989 594 aa9.51□□□□□ -0.89
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SNX13-201ENST00000409076 TERF2Q15554 542 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TAF3Q5VWG9 929 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 APPBP2Q92624 585 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 MARCH6O60337 910 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 SRGAP2O75044 1071 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 FOXO4P98177 505 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX13-201ENST00000409076 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 SIRT1Q96EB6 747 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX13-201ENST00000409076 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 HOXB7P09629 217 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 DCAF5Q96JK2 942 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TIGD1Q96MW7 591 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CSRNP2Q9H175 543 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 PDE6AP16499 860 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NLRP5P59047 1200 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 POSTNQ15063 836 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 FAM182BQ5T319 152 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ZSCAN12O43309 604 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 NEMFO60524 1076 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CLSTN1O94985 981 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CASP14P31944 242 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 USP5P45974 858 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 KIF5CO60282 957 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ABL1P00519 1130 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 CAPN2P17655 700 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 KIAA1328Q86T90 577 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 LCORLQ8N3X6 602 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX13-201ENST00000409076 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.49□□□□□ -0.89
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