RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 GSDMDP57764 484 aa26.7■■□□□ 1.87
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RABGGTA-202ENST00000399409 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-202ENST00000399409 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.7■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 SYKP43405 635 aa26.7■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.68■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 RESP18Q5W5W9 173 aa26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.67■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-202ENST00000399409 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.67■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 SHC4Q6S5L8 630 aa26.66■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 SKILP12757 684 aa26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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RABGGTA-202ENST00000399409 A0A0G2JS52 829 aa26.63■■□□□ 1.85
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RABGGTA-202ENST00000399409 TOMM22Q9NS69 142 aa26.63■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.63■■□□□ 1.85
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RABGGTA-202ENST00000399409 CCZ1BP86790 482 aa26.63■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.62■■□□□ 1.85
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RABGGTA-202ENST00000399409 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 SYCP1Q15431 976 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 TSC1Q92574 1164 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-202ENST00000399409 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.6■■□□□ 1.85
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