RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 TEX11Q8IYF3 940 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 FZD1Q9UP38 647 aa24.7■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 OTOFQ9HC10 1997 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 PICALMQ13492 652 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 UBE3CQ15386 1083 aa24.68■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.68■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.68■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC102AQ96A19 550 aa24.68■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 SLC10A3P09131 477 aa24.67■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 DCAF15Q66K64 600 aa24.67■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 CSRNP1Q96S65 589 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 PCNTO95613 3336 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 FLT1P17948 1338 aa24.65■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 MAP2K2P36507 400 aa24.65■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.65■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.65■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K10Q02779 954 aa24.64■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 NOGQ13253 232 aa24.64■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.64■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.64■■□□□ 1.54
CLDN3-201ENST00000395145 CHGBP05060 677 aa24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 GRM1Q13255 1194 aa24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 MYH1P12882 1939 aa24.63■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 AOC2O75106 756 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 NEFLP07196 543 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K9P80192 1104 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.62■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 SIPA1L1O43166 1804 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 TBC1D12O60347 775 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 IFFO2Q5TF58 517 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 LCORLQ8N3X6 602 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 EVI5LQ96CN4 794 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 WRNIP1Q96S55 665 aa24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 LAMB1P07942 1786 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 PDE4AP27815 886 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 USP5P45974 858 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 APPBP2Q92624 585 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 FSD1Q9BTV5 496 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.6■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 MBD4O95243 580 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 VGLL4Q14135 290 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 TICAM2Q86XR7 235 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 ARMT1Q9H993 441 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 CSADQ9Y600 493 aa24.59■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.58■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 SPRYD7Q5W111 196 aa24.58■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 ZIC5Q96T25 663 aa24.58■■□□□ 1.53
CLDN3-201ENST00000395145 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 OSBP2Q969R2 916 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 AIDAQ96BJ3 306 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 WNK4Q96J92 1243 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 PALD1Q9ULE6 856 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 INPP5BP32019 993 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 ELP3Q9H9T3 547 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 WBP1LQ9NX94 342 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.55■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
CLDN3-201ENST00000395145 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms