RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 SPATA5Q8NB90 893 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 IDI2Q9BXS1 227 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 POLA2Q14181 598 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRK-208ENST00000392449 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 SNRKQ9NRH2 765 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 POTEFA5A3E0 1075 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ENTPD3O75355 529 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 RHBDL3P58872 404 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 TLR2O60603 784 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ATP8B2P98198 1209 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 MOGSQ13724 837 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 SLF2Q8IX21 1173 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 SSH3Q8TE77 659 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 RAI14Q9P0K7 980 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 FAM196BA6NMK8 535 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 TNNI3KQ59H18 835 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 CPA4Q9UI42 421 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 DOCK1Q14185 1865 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 PDHXO00330 501 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 PANK1Q8TE04 598 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 CTGFP29279 349 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 PTPRFP10586 1907 aa20.39■□□□□ 0.86
PTPRK-208ENST00000392449 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 PTPRAP18433 802 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 ARMC5Q96C12 935 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 PICK1Q9NRD5 415 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CYP2C8P10632 490 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 GSTO1P78417 241 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 MAP3K10Q02779 954 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 C17orf99Q6UX52 265 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 GPR108Q9NPR9 543 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 LDHCP07864 332 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CEP85Q6P2H3 762 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 TEX11Q8IYF3 940 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 SIPA1L1O43166 1804 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 TRIM75PA6NK02 468 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CXCL11O14625 94 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 ZAP70P43403 619 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF333Q96JL9 665 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 TRIM47Q96LD4 638 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRK-208ENST00000392449 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms