RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 PDE6AP16499 860 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 KIF18AQ8NI77 898 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.551e-14■□□□□ 9.4
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PKP4-201ENST00000389757 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ADCY5O95622 1261 aa11.63□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 SV2BQ7L1I2 683 aa11.62□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 FAM193AP78312 1265 aa11.62□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 MAP7D2Q96T17 732 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 GBP3Q9H0R5 595 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 24.7
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PKP4-201ENST00000389757 HAUS7Q99871 368 aa11.62□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.61□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.61□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 NLRP10Q86W26 655 aa11.61□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 E7EWF7 191 aa11.61□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 PHKA1P46020 1223 aa11.6□□□□□ -0.55
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PKP4-201ENST00000389757 ELP1O95163 1332 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 CERKQ8TCT0 537 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 IFT74Q96LB3 600 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 MMP10P09238 476 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ANO1Q5XXA6 986 aa11.59□□□□□ -0.55
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