RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336180.6

LIMK1-201, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMK1, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-201ENST00000336180 USP17L8P0C7I0 530 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SPECC1Q5M775 1068 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SPC24Q8NBT2 197 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 AP5Z1O43299 807 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 GPSM2P81274 684 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 UFL1O94874 794 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 DDR1Q08345 913 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 MXD3Q9BW11 206 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 WTAPQ15007 396 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 C6orf229H3BNL8 230 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 STK38Q15208 465 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 FSIP1Q8NA03 581 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 SLURP2P0DP57 97 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 KRT40Q6A162 431 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 TNKSO95271 1327 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 BIN1O00499 593 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 TXNRD1Q16881 649 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF827Q17R98 1081 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 MYH7P12883 1935 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 MAP3K11Q16584 847 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 CTR9Q6PD62 1173 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 CLIC6Q96NY7 704 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 ZMYM6O95789 1325 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMK1-201ENST00000336180 LRP5O75197 1615 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 TYRO3Q06418 890 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 RTL9Q8NET4 1388 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ERICH2A1L162 156 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 FAM205CA6NFA0 338 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ADCY5O95622 1261 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 APBA3O96018 575 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 NR5A1Q13285 461 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 BTBD18B2RXH4 712 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 GRAPQ13588 217 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 CFAP45Q9UL16 551 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 KIF3AQ9Y496 699 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 RTN1Q16799 776 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 OXER1Q8TDS5 423 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ATRNO75882 1429 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 DOK7Q18PE1 504 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 USP5P45974 858 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 NTRK3Q16288 839 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 CPVLQ9H3G5 476 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 NDUFA8P51970 172 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 EVCP57679 992 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 ALX1Q15699 326 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 TMEM87BQ96K49 555 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMK1-201ENST00000336180 KRT23Q9C075 422 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms