RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 SMTNP53814 917 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ERCC3P19447 782 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TNFAIP3P21580 790 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ANKS4BQ8N8V4 417 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 GPAA1O43292 621 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 KIFC2Q96AC6 838 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 SEC24BO95487 1268 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 STRN3Q13033 797 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 PARP10Q53GL7 1025 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 STX10O60499 249 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 MNAT1P51948 309 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 KIFAP3Q92845 792 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 NUP160Q12769 1436 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SNX16P57768 344 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SPOPO43791 374 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 MYL5Q02045 173 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CPXCR1Q8N123 301 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 FAM170AA1A519 330 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SH3BP5O60239 455 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TRPC3Q13507 836 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 IFT74Q96LB3 600 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRKQ15262 1439 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA24Q86W54 205 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TTC14Q96N46 770 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TNNC1P63316 161 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP157Q5JU67 520 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CALCOCO2Q13137 446 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC14Q49A88 953 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CNGA4Q8IV77 575 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 E7EVH7 732 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM87BQ96K49 555 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 H0YIN7 160 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ANO1Q5XXA6 986 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SUCLG2Q96I99 432 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC160A6NGH7 325 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ORAI2Q96SN7 254 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC121Q6ZUS5 278 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 DYMQ7RTS9 669 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 PHKBQ93100 1093 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 GAS8O95995 478 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN2P17655 700 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SMC5Q8IY18 1101 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ASIC2Q16515 512 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CPLX4Q7Z7G2 160 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 VAV2P52735 878 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 INF2Q27J81 1249 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 TTC38Q5R3I4 469 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 APPBP2Q92624 585 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 DAPK3O43293 454 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SLC8A3P57103 927 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY7P51828 1080 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 USP19O94966 1318 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYM3Q14202 1370 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms