RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.96■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMC4P43686 418 aa30.96■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 SCYL3Q8IZE3 742 aa30.96■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 TNNQ9UQP3 1299 aa30.96■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa30.96■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM27P14373 513 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PRMT2P55345 433 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 MOGSQ13724 837 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 GCC1Q96CN9 775 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
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PPP4R4-202ENST00000328839 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.95■■■□□ 2.55
PPP4R4-202ENST00000328839 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 CXCL11O14625 94 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 MGAMO43451 1857 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 GNAI2P04899 355 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 MECOMQ03112 1051 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRA2Q96PE1 1338 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRFP10586 1907 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 BCAR3O75815 825 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 CTGFP29279 349 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM47Q96LD4 638 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 SLURP2P0DP57 97 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRAP18433 802 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PI16Q6UXB8 463 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 GADL1Q6ZQY3 521 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 SRRDQ9UH36 339 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PHIPQ8WWQ0 1821 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2C8P10632 490 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXD10P28358 340 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 GPAT2Q6NUI2 795 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA5Q8NB90 893 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 RAET1EQ8TD07 263 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 HMG20BQ9P0W2 317 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 OSBPP22059 807 aa30.9■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 RAI14Q9P0K7 980 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 MYPNQ86TC9 1320 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP4R4-202ENST00000328839 GSTO1P78417 241 aa30.88■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDH10Q9P2E7 1040 aa30.88■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa30.88■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 LDHCP07864 332 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 RHBDL3P58872 404 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF384Q8TF68 577 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 ATAD5Q96QE3 1844 aa30.87■■■□□ 2.53
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PPP4R4-202ENST00000328839 FCGRTP55899 365 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K10Q02779 954 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM196BA6NMK8 535 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 BCRP11274 1271 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 GRK4P32298 578 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 MTFR1Q15390 333 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 MCAMP43121 646 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 LRP2BPQ9P2M1 347 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4R4-202ENST00000328839 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 PRKCZQ05513 592 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 MAST2Q6P0Q8 1798 aa30.82■■■□□ 2.52
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PPP4R4-202ENST00000328839 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa30.81■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D12O60347 775 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 NPM3O75607 178 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC39AQ5SRH9 613 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 TEX11Q8IYF3 940 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 SNRKQ9NRH2 765 aa30.79■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 GABRQQ9UN88 632 aa30.79■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 UBXN2AP68543 259 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 CCL5P13501 91 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PPP4R4-202ENST00000328839 SHISA4Q96DD7 197 aa30.77■■■□□ 2.52
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