RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 PFKFB1P16118 471 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 IFNAR1P17181 557 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM67Q5HYA8 995 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 MICU3Q86XE3 530 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF202O95125 648 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 RXRAP19793 462 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 PHKBQ93100 1093 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 A0A087WWV3 80 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 PRKAB2O43741 272 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NBPF11Q86T75 865 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ADGRA1Q86SQ6 560 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NLRP12P59046 1061 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 RESP18Q5W5W9 173 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SHC4Q6S5L8 630 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 KCND1Q9NSA2 647 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NEMFO60524 1076 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 MAP7D2Q96T17 732 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 MYL10Q9BUA6 226 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NCAPHQ15003 741 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SDF4Q9BRK5 362 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB22O15209 634 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 SEC23AQ15436 765 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 BECN2A8MW95 431 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 MMP1P03956 469 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 UBE4AQ14139 1066 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 DRC7Q8IY82 874 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC69A6NI79 296 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 FAM177BA6PVY3 158 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 FGRP09769 529 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 CCZ1BP86790 482 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 PPARAQ07869 468 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 WASF1Q92558 559 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 GUCY1A2P33402 732 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 JMYQ8N9B5 988 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 IKBKBO14920 756 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 CUTAO60888 179 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 TMTC2Q8N394 836 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 TDO2P48775 406 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 WTAPQ15007 396 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 ERFEQ4G0M1 354 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF384Q8TF68 577 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4C-201ENST00000317868 SYKP43405 635 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms