RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CPA4Q9UI42 421 aa24.23■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.23■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 PICALMQ13492 652 aa24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 MOGSQ13724 837 aa24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 GNRH1P01148 92 aa24.21■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 PI16Q6UXB8 463 aa24.21■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.21■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA5Q8NB90 893 aa24.21■■□□□ 1.47
CXCL3-201ENST00000296026 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 CXCL11O14625 94 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K10Q02779 954 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF384Q8TF68 577 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 PICK1Q9NRD5 415 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.2■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.19■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 SLURP2P0DP57 97 aa24.19■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.19■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRAP18433 802 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 CTGFP29279 349 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 PRMT2P55345 433 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 RHBDL3P58872 404 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 LDHCP07864 332 aa24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 PSMC4P43686 418 aa24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 GSTO1P78417 241 aa24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 RAI14Q9P0K7 980 aa24.17■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 MCAMP43121 646 aa24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM47Q96LD4 638 aa24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 DOCK1Q14185 1865 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2C8P10632 490 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 SRRDQ9UH36 339 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-201ENST00000296026 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 POLA2Q14181 598 aa24.14■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.14■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.14■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 BCRP11274 1271 aa24.13■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 OSBPP22059 807 aa24.13■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 HOXD10P28358 340 aa24.13■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 CENPFP49454 3210 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 FAM196BA6NMK8 535 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D12O60347 775 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 ATP8B2P98198 1209 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 TNNI3KQ59H18 835 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 SSH3Q8TE77 659 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 GPR108Q9NPR9 543 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.12■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM75PA6NK02 468 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 RAET1EQ8TD07 263 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 SNRKQ9NRH2 765 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRFP10586 1907 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 MYPNQ86TC9 1320 aa24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 TEX11Q8IYF3 940 aa24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 FCGRTP55899 365 aa24.09■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 GCC1Q96CN9 775 aa24.09■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 GRK4P32298 578 aa24.08■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 MTFR1Q15390 333 aa24.08■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.08■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 MIER1Q8N108 512 aa24.08■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CXCL3-201ENST00000296026 MGAMO43451 1857 aa24.07■■□□□ 1.44
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