RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ATRNL1Q5VV63 1379 aa27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 SLC10A3P09131 477 aa27.03■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 PDE1AP54750 535 aa27.03■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 RASAL3Q86YV0 1011 aa27.03■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 THSD7BQ9C0I4 1608 aa27.03■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 AK9Q5TCS8 1911 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 SLURP2P0DP57 97 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 PLCG2P16885 1265 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 GRM1Q13255 1194 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 MIGA2Q7L4E1 593 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 FOCADQ5VW36 1801 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ERC2O15083 957 aa27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K10Q02779 954 aa27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 CCDC102AQ96A19 550 aa27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 MYH7P12883 1935 aa27.01■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 OTOFQ9HC10 1997 aa27■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 UNCXA6NJT0 531 aa27■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K2P36507 400 aa26.99■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.99■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 UBE3CQ15386 1083 aa26.98■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.98■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 FLT1P17948 1338 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K9P80192 1104 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 NOGQ13253 232 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 HOOK2Q96ED9 719 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 CSRNP1Q96S65 589 aa26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 CERS3Q8IU89 383 aa26.96■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.96■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 PDE4AP27815 886 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 DCAF15Q66K64 600 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 LCORLQ8N3X6 602 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 WBP1LQ9NX94 342 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-201ENST00000236273 SIPA1L1O43166 1804 aa26.95■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 INPP5BP32019 993 aa26.94■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 GJA5P36382 358 aa26.94■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 VGLL4Q14135 290 aa26.94■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D12O60347 775 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 SPRYD7Q5W111 196 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 WRNIP1Q96S55 665 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 ARMT1Q9H993 441 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.92■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 OSBP2Q969R2 916 aa26.92■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 ELP3Q9H9T3 547 aa26.92■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 PALD1Q9ULE6 856 aa26.92■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.92■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 MBD4O95243 580 aa26.91■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 WNK4Q96J92 1243 aa26.91■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 MYH1P12882 1939 aa26.91■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 PRKAB2O43741 272 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 FAM196BA6NMK8 535 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 USP5P45974 858 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-201ENST00000236273 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 APPBP2Q92624 585 aa26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 EVI5LQ96CN4 794 aa26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC18Q9H819 358 aa26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 OPTNQ96CV9 577 aa26.88■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 FSD1Q9BTV5 496 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms