RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 TMC1Q8TDI8 760 aa21.33■■□□□ 1.01
NFIC-211ENST00000641145 NRDCO43847 1150 aa21.32■■□□□ 1
NFIC-211ENST00000641145 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
NFIC-211ENST00000641145 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.29■■□□□ 1
NFIC-211ENST00000641145 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NFIC-211ENST00000641145 PLCB2Q00722 1185 aa21.24■□□□□ 0.99
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA2Q08379 1002 aa21.24■□□□□ 0.99
NFIC-211ENST00000641145 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
NFIC-211ENST00000641145 TONSLQ96HA7 1378 aa21.21■□□□□ 0.99
NFIC-211ENST00000641145 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.19■□□□□ 0.98
NFIC-211ENST00000641145 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
NFIC-211ENST00000641145 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
NFIC-211ENST00000641145 FGD1P98174 961 aa21.19■□□□□ 0.98
NFIC-211ENST00000641145 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
NFIC-211ENST00000641145 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
NFIC-211ENST00000641145 P3H3Q8IVL6 736 aa21.13■□□□□ 0.97
NFIC-211ENST00000641145 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
NFIC-211ENST00000641145 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NFIC-211ENST00000641145 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NFIC-211ENST00000641145 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NFIC-211ENST00000641145 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
NFIC-211ENST00000641145 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.08■□□□□ 0.96
NFIC-211ENST00000641145 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
NFIC-211ENST00000641145 KCNJ4P48050 445 aa21.05■□□□□ 0.96
NFIC-211ENST00000641145 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.02■□□□□ 0.96
NFIC-211ENST00000641145 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
NFIC-211ENST00000641145 DRC7Q8IY82 874 aa21.02■□□□□ 0.95
NFIC-211ENST00000641145 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
NFIC-211ENST00000641145 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
NFIC-211ENST00000641145 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.96■□□□□ 0.95
NFIC-211ENST00000641145 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 MRS2Q9HD23 443 aa20.92■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 CFAP53Q96M91 514 aa20.9■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.944e-7■■■■□ 22.7
NFIC-211ENST00000641145 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
NFIC-211ENST00000641145 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.88■□□□□ 0.93
NFIC-211ENST00000641145 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NFIC-211ENST00000641145 PDE4CQ08493 712 aa20.86■□□□□ 0.93
NFIC-211ENST00000641145 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.83■□□□□ 0.93
NFIC-211ENST00000641145 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 MCCP23508 829 aa20.77■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 CEP89Q96ST8 783 aa20.77■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 USP35Q9P2H5 1018 aa20.77■□□□□ 0.92
NFIC-211ENST00000641145 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.76■□□□□ 0.91
NFIC-211ENST00000641145 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
NFIC-211ENST00000641145 TSPY4P0CV99 314 aa20.75■□□□□ 0.91
NFIC-211ENST00000641145 TSPY10P0CW01 314 aa20.75■□□□□ 0.91
NFIC-211ENST00000641145 FBXO3Q9UK99 471 aa20.74■□□□□ 0.91
NFIC-211ENST00000641145 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
NFIC-211ENST00000641145 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.68■□□□□ 0.9
NFIC-211ENST00000641145 HSCBQ8IWL3 235 aa20.68■□□□□ 0.9
NFIC-211ENST00000641145 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
NFIC-211ENST00000641145 TPM4P67936 248 aa20.67■□□□□ 0.9
NFIC-211ENST00000641145 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.65■□□□□ 0.9
NFIC-211ENST00000641145 NUDCQ9Y266 331 aa20.64■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 CDCA8Q53HL2 280 aa20.63■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.63■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 MS4A1P11836 297 aa20.62■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.61■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 NEUROD2Q15784 382 aa20.59■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 G3V3G9 751 aa20.59■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.59■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.59■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NFIC-211ENST00000641145 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 RGS3P49796 1198 aa20.58■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 CFAP44Q96MT7 982 aa20.57■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.56■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 ARID3AQ99856 593 aa20.55■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.54■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 VPS53Q5VIR6 699 aa20.54■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 POGKQ9P215 609 aa20.53■□□□□ 0.88
NFIC-211ENST00000641145 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 TPM3P06753 285 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 PTMSP20962 102 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 WWC1Q8IX03 1113 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NFIC-211ENST00000641145 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 MARCH6O60337 910 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 RGL3Q3MIN7 710 aa20.43■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 GORABQ5T7V8 394 aa20.42■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.41■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
NFIC-211ENST00000641145 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms