RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625888.2

PCBP1-AS1-286, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 765 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.29□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZMYND15Q9H091 742 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SCRIBQ14160 1630 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 P3H3Q8IVL6 736 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 NEUROD2Q15784 382 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 BICRAQ9NZM4 1560 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TRIM41Q8WV44 630 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ARID3AQ99856 593 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 WDR70Q9NW82 654 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 MIER1Q8N108 512 aa9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.97□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SMARCA4P51532 1647 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 PLEKHG5O94827 1062 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 NECTIN2Q92692 538 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 APBB1O00213 710 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SMARCA2P51531 1590 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 NCAPD3P42695 1498 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 STK25O00506 426 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZMYND10O75800 440 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 GSE1Q14687 1217 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ARID3CA6NKF2 412 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RAD21O60216 631 aa9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 IL27Q8NEV9 243 aa9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 HMGXB3Q12766 1538 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 FLIIQ13045 1269 aa9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 AK7Q96M32 723 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.79□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 WIZO95785 1651 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 IGSF3O75054 1194 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 BARGINQ6ZT62 677 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RGS22Q8NE09 1264 aa9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 POLA2Q14181 598 aa9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 POTEHQ6S545 545 aa9.74□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.74□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.74□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 STK24Q9Y6E0 443 aa9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 A6NJR5 290 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 SEMA3EO15041 775 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RNF39Q9H2S5 420 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 MTMR7Q9Y216 660 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 TRAK2O60296 914 aa9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-286ENST00000625888 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms