RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585645.5

GTF3C2-AS1-203, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 422 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FBXO3Q9UK99 471 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KIF12Q96FN5 646 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RASEFQ8IZ41 740 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NUBP1P53384 320 aa9.69□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.69□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 C7P10643 843 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLC39A7Q92504 469 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MAP3K13O43283 966 aa9.65□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TIE1P35590 1138 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FAM212AQ96EL1 285 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 METRNQ9UJH8 293 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEB2H3BUK9 544 aa9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 OTUD5Q96G74 571 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.58□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TRPC6Q9Y210 931 aa9.54□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 IER5LQ5T953 404 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 IFNL1Q8IU54 200 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GSE1Q14687 1217 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KLHL34Q8N239 644 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEJP0CG39 1038 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEFA5A3E0 1075 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SEC24BO95487 1268 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PYGBP11216 843 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SPOCK2Q92563 424 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PLCG2P16885 1265 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 OCEL1Q9H607 264 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEMA6NI47 508 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TRIM41Q8WV44 630 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 POTEGQ6S5H5 508 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PSEN1P49768 467 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GOLGA2Q08379 1002 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SNPHO15079 494 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NACADO15069 1562 aa9.15□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CABP2Q9NPB3 220 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ST18O60284 1047 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 G3V3G9 751 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.03□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SOX12O15370 315 aa9.02□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.02□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.02□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MICALL2Q8IY33 904 aa8.91□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MARVELD3Q96A59 401 aa8.91□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EMP3P54852 163 aa8.9□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NLRP6P59044 892 aa8.9□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DOK7Q18PE1 504 aa8.9□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.9□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms