RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEB2H3BUK9 544 aa14.24□□□□□ -0.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.24□□□□□ -0.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 RASEFQ8IZ41 740 aa14.22□□□□□ -0.13
USP3-AS1-202ENST00000559357 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.19□□□□□ -0.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEMA6NI47 508 aa14.18□□□□□ -0.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXO3Q9UK99 471 aa14.17□□□□□ -0.14
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUBP1P53384 320 aa14.14□□□□□ -0.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF12Q96FN5 646 aa14.14□□□□□ -0.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEGQ6S5H5 508 aa14.12□□□□□ -0.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP3K13O43283 966 aa14.05□□□□□ -0.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM212AQ96EL1 285 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRPC6Q9Y210 931 aa13.98□□□□□ -0.17
USP3-AS1-202ENST00000559357 METRNQ9UJH8 293 aa13.96□□□□□ -0.17
USP3-AS1-202ENST00000559357 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEJP0CG39 1038 aa13.94□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.94□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 C7P10643 843 aa13.92□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 TIE1P35590 1138 aa13.92□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC39A7Q92504 469 aa13.92□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.92□□□□□ -0.18
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.88□□□□□ -0.19
USP3-AS1-202ENST00000559357 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.87□□□□□ -0.19
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHL34Q8N239 644 aa13.87□□□□□ -0.19
USP3-AS1-202ENST00000559357 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFNL1Q8IU54 200 aa13.86□□□□□ -0.19
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.85□□□□□ -0.19
USP3-AS1-202ENST00000559357 PYGBP11216 843 aa13.81□□□□□ -0.2
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEFA5A3E0 1075 aa13.78□□□□□ -0.2
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSE1Q14687 1217 aa13.77□□□□□ -0.21
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.75□□□□□ -0.21
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.72□□□□□ -0.21
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPOCK2Q92563 424 aa13.71□□□□□ -0.21
USP3-AS1-202ENST00000559357 IER5LQ5T953 404 aa13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-202ENST00000559357 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEC24BO95487 1268 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-202ENST00000559357 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-202ENST00000559357 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLCG2P16885 1265 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSEN1P49768 467 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-202ENST00000559357 OCEL1Q9H607 264 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM41Q8WV44 630 aa13.43□□□□□ -0.26
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOLGA2Q08379 1002 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-202ENST00000559357 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP3-AS1-202ENST00000559357 ST18O60284 1047 aa13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-202ENST00000559357 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-202ENST00000559357 CABP2Q9NPB3 220 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MMRN1Q13201 1228 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.21□□□□□ -0.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.19□□□□□ -0.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNPHO15079 494 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PKD2Q13563 968 aa13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOX12O15370 315 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 G3V3G9 751 aa13.06□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 MARVELD3Q96A59 401 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGL2O15211 777 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-202ENST00000559357 MICALL2Q8IY33 904 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-202ENST00000559357 STK24Q9Y6E0 443 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-202ENST00000559357 STK25O00506 426 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.96□□□□□ -0.33
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLRP6P59044 892 aa12.93□□□□□ -0.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.93□□□□□ -0.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFRPQ9BY79 579 aa12.92□□□□□ -0.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 EMP3P54852 163 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.9□□□□□ -0.34
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102 ms