RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP15-218ENST00000552346 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP15-218ENST00000552346 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
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USP15-218ENST00000552346 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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USP15-218ENST00000552346 SLC39A7Q92504 469 aa15.42■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 METRNQ9UJH8 293 aa15.42■□□□□ 0.06
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USP15-218ENST00000552346 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
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USP15-218ENST00000552346 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
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USP15-218ENST00000552346 SPOCK2Q92563 424 aa15.01□□□□□ -0.01
USP15-218ENST00000552346 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
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USP15-218ENST00000552346 PLCG2P16885 1265 aa14.97□□□□□ -0.01
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USP15-218ENST00000552346 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-218ENST00000552346 POTEMA6NI47 508 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-218ENST00000552346 OCEL1Q9H607 264 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 POTEGQ6S5H5 508 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 PSEN1P49768 467 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 GOLGA2Q08379 1002 aa14.84□□□□□ -0.03
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USP15-218ENST00000552346 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
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USP15-218ENST00000552346 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 29.6
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USP15-218ENST00000552346 CABP2Q9NPB3 220 aa14.68□□□□□ -0.06
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USP15-218ENST00000552346 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP15-218ENST00000552346 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-218ENST00000552346 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-218ENST00000552346 ST18O60284 1047 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-218ENST00000552346 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-218ENST00000552346 SNPHO15079 494 aa14.55□□□□□ -0.08
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USP15-218ENST00000552346 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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USP15-218ENST00000552346 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
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USP15-218ENST00000552346 SOX12O15370 315 aa14.37□□□□□ -0.11
USP15-218ENST00000552346 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.34□□□□□ -0.11
USP15-218ENST00000552346 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.31□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 EMP3P54852 163 aa14.29□□□□□ -0.12
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USP15-218ENST00000552346 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
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USP15-218ENST00000552346 DOK7Q18PE1 504 aa14.2□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.2□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 FAM205CA6NFA0 338 aa14.19□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.19□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 RGL2O15211 777 aa14.18□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.18□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.17□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 POTEB3A0JP26 581 aa14.14□□□□□ -0.15
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