RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 RASEFQ8IZ41 740 aa15.63■□□□□ 0.09
USP15-218ENST00000552346 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP15-218ENST00000552346 KIF12Q96FN5 646 aa15.57■□□□□ 0.08
USP15-218ENST00000552346 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP15-218ENST00000552346 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
USP15-218ENST00000552346 FBXO3Q9UK99 471 aa15.52■□□□□ 0.08
USP15-218ENST00000552346 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP15-218ENST00000552346 NUBP1P53384 320 aa15.5■□□□□ 0.07
USP15-218ENST00000552346 MAP3K13O43283 966 aa15.49■□□□□ 0.07
USP15-218ENST00000552346 POTEB2H3BUK9 544 aa15.42■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 SLC39A7Q92504 469 aa15.42■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 METRNQ9UJH8 293 aa15.42■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 FAM212AQ96EL1 285 aa15.41■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 TRPC6Q9Y210 931 aa15.41■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 C7P10643 843 aa15.4■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
USP15-218ENST00000552346 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP15-218ENST00000552346 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.36■□□□□ 0.05
USP15-218ENST00000552346 TIE1P35590 1138 aa15.35■□□□□ 0.05
USP15-218ENST00000552346 OTUD5Q96G74 571 aa15.35■□□□□ 0.05
USP15-218ENST00000552346 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.35■□□□□ 0.05
USP15-218ENST00000552346 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
USP15-218ENST00000552346 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.3■□□□□ 0.04
USP15-218ENST00000552346 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.28■□□□□ 0.04
USP15-218ENST00000552346 KLHL34Q8N239 644 aa15.27■□□□□ 0.04
USP15-218ENST00000552346 IFNL1Q8IU54 200 aa15.26■□□□□ 0.03
USP15-218ENST00000552346 POTEJP0CG39 1038 aa15.21■□□□□ 0.03
USP15-218ENST00000552346 PYGBP11216 843 aa15.2■□□□□ 0.02
USP15-218ENST00000552346 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.19■□□□□ 0.02
USP15-218ENST00000552346 POTEFA5A3E0 1075 aa15.18■□□□□ 0.02
USP15-218ENST00000552346 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.17■□□□□ 0.02
USP15-218ENST00000552346 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.15■□□□□ 0.02
USP15-218ENST00000552346 SEC24BO95487 1268 aa15.14■□□□□ 0.01
USP15-218ENST00000552346 GSE1Q14687 1217 aa15.13■□□□□ 0.01
USP15-218ENST00000552346 IER5LQ5T953 404 aa15.12■□□□□ 0.01
USP15-218ENST00000552346 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP15-218ENST00000552346 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.1■□□□□ 0.01
USP15-218ENST00000552346 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.08■□□□□ 0
USP15-218ENST00000552346 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
USP15-218ENST00000552346 SPOCK2Q92563 424 aa15.01□□□□□ -0.01
USP15-218ENST00000552346 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP15-218ENST00000552346 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP15-218ENST00000552346 PLCG2P16885 1265 aa14.97□□□□□ -0.01
USP15-218ENST00000552346 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-218ENST00000552346 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-218ENST00000552346 POTEMA6NI47 508 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-218ENST00000552346 OCEL1Q9H607 264 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 POTEGQ6S5H5 508 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 PSEN1P49768 467 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 GOLGA2Q08379 1002 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-218ENST00000552346 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-218ENST00000552346 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP15-218ENST00000552346 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP15-218ENST00000552346 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
USP15-218ENST00000552346 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-218ENST00000552346 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP15-218ENST00000552346 TRIM41Q8WV44 630 aa14.71□□□□□ -0.05
USP15-218ENST00000552346 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 29.6
USP15-218ENST00000552346 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP15-218ENST00000552346 CABP2Q9NPB3 220 aa14.68□□□□□ -0.06
USP15-218ENST00000552346 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.66□□□□□ -0.06
USP15-218ENST00000552346 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP15-218ENST00000552346 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.62□□□□□ -0.07
USP15-218ENST00000552346 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP15-218ENST00000552346 ST18O60284 1047 aa14.59□□□□□ -0.07
USP15-218ENST00000552346 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-218ENST00000552346 SNPHO15079 494 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-218ENST00000552346 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP15-218ENST00000552346 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.51□□□□□ -0.09
USP15-218ENST00000552346 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP15-218ENST00000552346 G3V3G9 751 aa14.5□□□□□ -0.09
USP15-218ENST00000552346 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.48□□□□□ -0.09
USP15-218ENST00000552346 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP15-218ENST00000552346 MARVELD3Q96A59 401 aa14.38□□□□□ -0.11
USP15-218ENST00000552346 SOX12O15370 315 aa14.37□□□□□ -0.11
USP15-218ENST00000552346 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.34□□□□□ -0.11
USP15-218ENST00000552346 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.31□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 EMP3P54852 163 aa14.29□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.29□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 MICALL2Q8IY33 904 aa14.28□□□□□ -0.12
USP15-218ENST00000552346 STK24Q9Y6E0 443 aa14.26□□□□□ -0.13
USP15-218ENST00000552346 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
USP15-218ENST00000552346 NLRP6P59044 892 aa14.22□□□□□ -0.13
USP15-218ENST00000552346 PKD2Q13563 968 aa14.22□□□□□ -0.13
USP15-218ENST00000552346 STK25O00506 426 aa14.21□□□□□ -0.13
USP15-218ENST00000552346 DOK7Q18PE1 504 aa14.2□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.2□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 FAM205CA6NFA0 338 aa14.19□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.19□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 RGL2O15211 777 aa14.18□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.18□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.17□□□□□ -0.14
USP15-218ENST00000552346 POTEB3A0JP26 581 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms