RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 CFAP53Q96M91 514 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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PTPRB-208ENST00000550358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
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PTPRB-208ENST00000550358 ABCC8Q09428 1581 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
PTPRB-208ENST00000550358 CUX2O14529 1486 aa11.26□□□□□ -0.61
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PTPRB-208ENST00000550358 FMN1Q68DA7 1419 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRB-208ENST00000550358 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
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PTPRB-208ENST00000550358 MS4A1P11836 297 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRB-208ENST00000550358 MRS2Q9HD23 443 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRB-208ENST00000550358 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRB-208ENST00000550358 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 NUDCQ9Y266 331 aa11.21□□□□□ -0.62
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PTPRB-208ENST00000550358 KCNH8Q96L42 1107 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.19□□□□□ -0.62
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PTPRB-208ENST00000550358 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.19□□□□□ -0.62
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PTPRB-208ENST00000550358 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 FKBP8Q14318 412 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 BECN1Q14457 450 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRB-208ENST00000550358 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRB-208ENST00000550358 SOGA1O94964 1423 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRB-208ENST00000550358 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf37Q86TY3 774 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 TMF1P82094 1093 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.12□□□□□ -0.63
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PTPRB-208ENST00000550358 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 POGKQ9P215 609 aa11.11□□□□□ -0.63
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PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.1□□□□□ -0.63
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PTPRB-208ENST00000550358 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 CCER2I3L3R5 266 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 NCAPD3P42695 1498 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 BCL11AQ9H165 835 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRB-208ENST00000550358 UACAQ9BZF9 1416 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRB-208ENST00000550358 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRB-208ENST00000550358 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
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PTPRB-208ENST00000550358 WIZO95785 1651 aa10.98□□□□□ -0.65
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PTPRB-208ENST00000550358 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRB-208ENST00000550358 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRB-208ENST00000550358 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRB-208ENST00000550358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.97□□□□□ -0.65
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PTPRB-208ENST00000550358 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 STAC3Q96MF2 364 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 MIER1Q8N108 512 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 CUX1P39880 1505 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 PTMSP20962 102 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 MORC1Q86VD1 984 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa10.92□□□□□ -0.66
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