RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.25□□□□□ -0.45
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.19□□□□□ -0.46
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RGL2O15211 777 aa12.18□□□□□ -0.46
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GABBR2O75899 941 aa12.16□□□□□ -0.46
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PHF12Q96QT6 1004 aa12.13□□□□□ -0.47
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BCANQ96GW7 911 aa12.12□□□□□ -0.47
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUBP1P53384 320 aa12.09□□□□□ -0.47
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CFAP44Q96MT7 982 aa12.08□□□□□ -0.48
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.04□□□□□ -0.48
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.03□□□□□ -0.48
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM41Q8WV44 630 aa12.01□□□□□ -0.49
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12□□□□□ -0.49
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM212AQ96EL1 285 aa12□□□□□ -0.49
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CLCN6P51797 869 aa11.98□□□□□ -0.49
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.94□□□□□ -0.5
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAP3K13O43283 966 aa11.93□□□□□ -0.5
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.93□□□□□ -0.5
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.92□□□□□ -0.5
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GSE1Q14687 1217 aa11.91□□□□□ -0.5
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PYGBP11216 843 aa11.89□□□□□ -0.51
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.85□□□□□ -0.51
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.83□□□□□ -0.52
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRPC6Q9Y210 931 aa11.83□□□□□ -0.52
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 IFNL1Q8IU54 200 aa11.8□□□□□ -0.52
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.76□□□□□ -0.53
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TIE1P35590 1138 aa11.69□□□□□ -0.54
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.67□□□□□ -0.54
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NBR1Q14596 966 aa11.65□□□□□ -0.54
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.62□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 METRNQ9UJH8 293 aa11.61□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC39A7Q92504 469 aa11.6□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C7P10643 843 aa11.59□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 STK24Q9Y6E0 443 aa11.59□□□□□ -0.55
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PSEN1P49768 467 aa11.58□□□□□ -0.56
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEB2H3BUK9 544 aa11.54□□□□□ -0.56
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SEC24BO95487 1268 aa11.52□□□□□ -0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEFA5A3E0 1075 aa11.51□□□□□ -0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GOLGA2Q08379 1002 aa11.49□□□□□ -0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 IER5LQ5T953 404 aa11.47□□□□□ -0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CABP2Q9NPB3 220 aa11.46□□□□□ -0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEJP0CG39 1038 aa11.44□□□□□ -0.58
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLCG2P16885 1265 aa11.43□□□□□ -0.58
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OTUD5Q96G74 571 aa11.39□□□□□ -0.59
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OCEL1Q9H607 264 aa11.39□□□□□ -0.59
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 P3H3Q8IVL6 736 aa11.36□□□□□ -0.59
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.36□□□□□ -0.59
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.34□□□□□ -0.59
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.31□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.3□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MFRPQ9BY79 579 aa11.3□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.3□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.29□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WDR70Q9NW82 654 aa11.28□□□□□ -0.6
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.25□□□□□ -0.61
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SOX12O15370 315 aa11.23□□□□□ -0.61
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