RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RNU6-988P-201ENST00000519081 RASEFQ8IZ41 740 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIF12Q96FN5 646 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU6-988P-201ENST00000519081 FKBP8Q14318 412 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU6-988P-201ENST00000519081 OTUD5Q96G74 571 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLEKHG5O94827 1062 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAP3K13O43283 966 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 NUBP1P53384 320 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 TRPC6Q9Y210 931 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 METRNQ9UJH8 293 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 POTEJP0CG39 1038 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 C7P10643 843 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC39A7Q92504 469 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RNU6-988P-201ENST00000519081 POTEFA5A3E0 1075 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-988P-201ENST00000519081 TIE1P35590 1138 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RNU6-988P-201ENST00000519081 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-988P-201ENST00000519081 TTLL13PA6NNM8 815 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-988P-201ENST00000519081 IFNL1Q8IU54 200 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM212AQ96EL1 285 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-988P-201ENST00000519081 FBXO3Q9UK99 471 aa9.95□□□□□ -0.82
RNU6-988P-201ENST00000519081 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-988P-201ENST00000519081 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-988P-201ENST00000519081 IER5LQ5T953 404 aa9.89□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.87□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.86□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 POTEMA6NI47 508 aa9.85□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 PYGBP11216 843 aa9.85□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.85□□□□□ -0.83
RNU6-988P-201ENST00000519081 SEC24BO95487 1268 aa9.83□□□□□ -0.84
RNU6-988P-201ENST00000519081 POTEGQ6S5H5 508 aa9.83□□□□□ -0.84
RNU6-988P-201ENST00000519081 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.8□□□□□ -0.84
RNU6-988P-201ENST00000519081 KLHL34Q8N239 644 aa9.77□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 GSE1Q14687 1217 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLCG2P16885 1265 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 OCEL1Q9H607 264 aa9.72□□□□□ -0.85
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.7□□□□□ -0.86
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-988P-201ENST00000519081 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPOCK2Q92563 424 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-988P-201ENST00000519081 PSEN1P49768 467 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-988P-201ENST00000519081 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RNU6-988P-201ENST00000519081 ST18O60284 1047 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-988P-201ENST00000519081 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 GOLGA2Q08379 1002 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 CABP2Q9NPB3 220 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 TRIM41Q8WV44 630 aa9.48□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 SNPHO15079 494 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-988P-201ENST00000519081 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RNU6-988P-201ENST00000519081 MARVELD3Q96A59 401 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-988P-201ENST00000519081 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-988P-201ENST00000519081 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-988P-201ENST00000519081 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 POTEB3A0JP26 581 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 POTEBQ6S5H4 581 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.34□□□□□ -0.91
RNU6-988P-201ENST00000519081 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SOX12O15370 315 aa9.32□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.32□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 G3V3G9 751 aa9.31□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 EMP3P54852 163 aa9.31□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.31□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MICALL2Q8IY33 904 aa9.3□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.3□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MMRN1Q13201 1228 aa9.28□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.28□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.28□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.28□□□□□ -0.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM205CA6NFA0 338 aa9.27□□□□□ -0.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.24□□□□□ -0.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 DOK7Q18PE1 504 aa9.23□□□□□ -0.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.2□□□□□ -0.94
RNU6-988P-201ENST00000519081 PKD2Q13563 968 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms