RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1-202ENST00000517309 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-202ENST00000517309 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1-202ENST00000517309 MRS2Q9HD23 443 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-202ENST00000517309 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 CDCA8Q53HL2 280 aa23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 FKBP8Q14318 412 aa23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1-202ENST00000517309 CUX2O14529 1486 aa23.33■■□□□ 1.32
PTDSS1-202ENST00000517309 SMARCA2P51531 1590 aa23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1-202ENST00000517309 RGL3Q3MIN7 710 aa23.3■■□□□ 1.32
PTDSS1-202ENST00000517309 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1-202ENST00000517309 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1-202ENST00000517309 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1-202ENST00000517309 C14orf37Q86TY3 774 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-202ENST00000517309 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1-202ENST00000517309 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1-202ENST00000517309 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.2■■□□□ 1.31
PTDSS1-202ENST00000517309 CFAP53Q96M91 514 aa23.19■■□□□ 1.3
PTDSS1-202ENST00000517309 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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PTDSS1-202ENST00000517309 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.17■■□□□ 1.3
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.16■■□□□ 1.3
PTDSS1-202ENST00000517309 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.16■■□□□ 1.3
PTDSS1-202ENST00000517309 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.14■■□□□ 1.3
PTDSS1-202ENST00000517309 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.14■■□□□ 1.29
PTDSS1-202ENST00000517309 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.12■■□□□ 1.29
PTDSS1-202ENST00000517309 SOGA1O94964 1423 aa23.11■■□□□ 1.29
PTDSS1-202ENST00000517309 KANK1Q14678 1352 aa23.1■■□□□ 1.29
PTDSS1-202ENST00000517309 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTDSS1-202ENST00000517309 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.07■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 MIER1Q8N108 512 aa23.07■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 POGKQ9P215 609 aa23.05■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0G2JS52 829 aa23.02■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.02■■□□□ 1.28
PTDSS1-202ENST00000517309 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.99■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.99■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 NUDCQ9Y266 331 aa22.98■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 FMN1Q68DA7 1419 aa22.97■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHG5O94827 1062 aa22.95■■□□□ 1.27
PTDSS1-202ENST00000517309 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTDSS1-202ENST00000517309 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-202ENST00000517309 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-202ENST00000517309 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS1-202ENST00000517309 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS1-202ENST00000517309 ABCC8Q09428 1581 aa22.89■■□□□ 1.26
PTDSS1-202ENST00000517309 TMF1P82094 1093 aa22.89■■□□□ 1.26
PTDSS1-202ENST00000517309 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS1-202ENST00000517309 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTDSS1-202ENST00000517309 MLECQ14165 292 aa22.82■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.82■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 GGT6Q6P531 493 aa22.81■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.79■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 PKD2Q13563 968 aa22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.77■■□□□ 1.24
PTDSS1-202ENST00000517309 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 WIZO95785 1651 aa22.76■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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PTDSS1-202ENST00000517309 MS4A1P11836 297 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 BECN1Q14457 450 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-202ENST00000517309 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 ARXQ96QS3 562 aa22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 JPH4Q96JJ6 628 aa22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 NUP155O75694 1391 aa22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 SMARCA4P51532 1647 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 CASC1Q6TDU7 716 aa22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1-202ENST00000517309 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 MORC1Q86VD1 984 aa22.63■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF3BO15066 747 aa22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.58■■□□□ 1.21
PTDSS1-202ENST00000517309 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
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