RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUBP1P53384 320 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 RASEFQ8IZ41 740 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 PKD2Q13563 968 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 MMRN1Q13201 1228 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM212AQ96EL1 285 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 PYGBP11216 843 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 GSE1Q14687 1217 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEB2H3BUK9 544 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGL2O15211 777 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF12Q96QT6 1004 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP3K13O43283 966 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF12Q96FN5 646 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFNL1Q8IU54 200 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM41Q8WV44 630 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRPC6Q9Y210 931 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHGAP10645 457 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 VGFO15240 615 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSEN1P49768 467 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 STK25O00506 426 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 STK24Q9Y6E0 443 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 CABP2Q9NPB3 220 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 TIE1P35590 1138 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 C7P10643 843 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC39A7Q92504 469 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 MFRPQ9BY79 579 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 METRNQ9UJH8 293 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEJP0CG39 1038 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 CFAP44Q96MT7 982 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF8Q9UPP1 1060 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA2Q08379 1002 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 MS4A4AQ96JQ5 239 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLCB2Q00722 1185 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXO22Q8NEZ5 403 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEFA5A3E0 1075 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP1R37O75864 691 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOX12O15370 315 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 NLRP6P59044 892 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEC24BO95487 1268 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 IER5LQ5T953 404 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms