RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASEFQ8IZ41 740 aa10.67□□□□□ -0.7
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF12Q96FN5 646 aa10.63□□□□□ -0.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO3Q9UK99 471 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP3K13O43283 966 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM212AQ96EL1 285 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 METRNQ9UJH8 293 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUBP1P53384 320 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC39A7Q92504 469 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 C7P10643 843 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTEB2H3BUK9 544 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRPC6Q9Y210 931 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL34Q8N239 644 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 OTUD5Q96G74 571 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIE1P35590 1138 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.44□□□□□ -0.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFNL1Q8IU54 200 aa10.43□□□□□ -0.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC24BO95487 1268 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 PYGBP11216 843 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.4□□□□□ -0.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTEJP0CG39 1038 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTEFA5A3E0 1075 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSE1Q14687 1217 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 IER5LQ5T953 404 aa10.33□□□□□ -0.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.32□□□□□ -0.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLCG2P16885 1265 aa10.28□□□□□ -0.76
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPOCK2Q92563 424 aa10.26□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTEMA6NI47 508 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLGA2Q08379 1002 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTEGQ6S5H5 508 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 OCEL1Q9H607 264 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSEN1P49768 467 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CABP2Q9NPB3 220 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM41Q8WV44 630 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU6-277P-201ENST00000516272 G3V3G9 751 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST18O60284 1047 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNPHO15079 494 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.91□□□□□ -0.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARVELD3Q96A59 401 aa9.88□□□□□ -0.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 EMP3P54852 163 aa9.82□□□□□ -0.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.82□□□□□ -0.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOX12O15370 315 aa9.81□□□□□ -0.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.78□□□□□ -0.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MICALL2Q8IY33 904 aa9.77□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.77□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK24Q9Y6E0 443 aa9.77□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM205CA6NFA0 338 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK25O00506 426 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOK7Q18PE1 504 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP6P59044 892 aa9.72□□□□□ -0.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIMBP2O15034 1052 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.71□□□□□ -0.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGL2O15211 777 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PKD2Q13563 968 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERBB3P21860 1342 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms