RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516123.1

SNORD116-28-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-28, humanhuman

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Gene SNORD116-28, Length 91 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-28-201ENST00000516123 METRNQ9UJH8 293 aa8.09□□□□□ -1.11
SNORD116-28-201ENST00000516123 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.08□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEB2H3BUK9 544 aa8.07□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 PROM2Q8N271 834 aa8.07□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEMA6NI47 508 aa8.03□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.03□□□□□ -1.12
SNORD116-28-201ENST00000516123 MIER1Q8N108 512 aa8.02□□□□□ -1.13
SNORD116-28-201ENST00000516123 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.01□□□□□ -1.13
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEGQ6S5H5 508 aa8□□□□□ -1.13
SNORD116-28-201ENST00000516123 KIF12Q96FN5 646 aa8□□□□□ -1.13
SNORD116-28-201ENST00000516123 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.97□□□□□ -1.13
SNORD116-28-201ENST00000516123 TIE1P35590 1138 aa7.96□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.96□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 MAP3K13O43283 966 aa7.94□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 SEC24BO95487 1268 aa7.93□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 RASEFQ8IZ41 740 aa7.93□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEJP0CG39 1038 aa7.92□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.9□□□□□ -1.14
SNORD116-28-201ENST00000516123 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.88□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRPC6Q9Y210 931 aa7.88□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.88□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 IER5LQ5T953 404 aa7.87□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 FAM212AQ96EL1 285 aa7.86□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEFA5A3E0 1075 aa7.85□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.85□□□□□ -1.15
SNORD116-28-201ENST00000516123 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SNORD116-28-201ENST00000516123 NUBP1P53384 320 aa7.81□□□□□ -1.16
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLCG2P16885 1265 aa7.8□□□□□ -1.16
SNORD116-28-201ENST00000516123 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.8□□□□□ -1.16
SNORD116-28-201ENST00000516123 IFNL1Q8IU54 200 aa7.79□□□□□ -1.16
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.77□□□□□ -1.17
SNORD116-28-201ENST00000516123 FKBP8Q14318 412 aa7.75□□□□□ -1.17
SNORD116-28-201ENST00000516123 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.74□□□□□ -1.17
SNORD116-28-201ENST00000516123 FBXO3Q9UK99 471 aa7.73□□□□□ -1.17
SNORD116-28-201ENST00000516123 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.72□□□□□ -1.17
SNORD116-28-201ENST00000516123 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 OCEL1Q9H607 264 aa7.7□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 SNPHO15079 494 aa7.69□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 PYGBP11216 843 aa7.68□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 ST18O60284 1047 aa7.67□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 GOLGA2Q08379 1002 aa7.65□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 GSE1Q14687 1217 aa7.65□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 KLHL34Q8N239 644 aa7.65□□□□□ -1.18
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
SNORD116-28-201ENST00000516123 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.64□□□□□ -1.19
SNORD116-28-201ENST00000516123 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.62□□□□□ -1.19
SNORD116-28-201ENST00000516123 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SNORD116-28-201ENST00000516123 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
SNORD116-28-201ENST00000516123 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SNORD116-28-201ENST00000516123 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNORD116-28-201ENST00000516123 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
SNORD116-28-201ENST00000516123 PSEN1P49768 467 aa7.54□□□□□ -1.2
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SNORD116-28-201ENST00000516123 G3V3G9 751 aa7.53□□□□□ -1.2
SNORD116-28-201ENST00000516123 EMP3P54852 163 aa7.52□□□□□ -1.21
SNORD116-28-201ENST00000516123 MMRN1Q13201 1228 aa7.51□□□□□ -1.21
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SNORD116-28-201ENST00000516123 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.51□□□□□ -1.21
SNORD116-28-201ENST00000516123 SPOCK2Q92563 424 aa7.47□□□□□ -1.21
SNORD116-28-201ENST00000516123 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 CABP2Q9NPB3 220 aa7.45□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 FAM205CA6NFA0 338 aa7.44□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.43□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.43□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.42□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 DOK7Q18PE1 504 aa7.4□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRIM41Q8WV44 630 aa7.4□□□□□ -1.22
SNORD116-28-201ENST00000516123 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.39□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 RIMBP2O15034 1052 aa7.38□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.37□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.37□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 ERBB3P21860 1342 aa7.35□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEB3A0JP26 581 aa7.35□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 POTEBQ6S5H4 581 aa7.35□□□□□ -1.23
SNORD116-28-201ENST00000516123 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.31□□□□□ -1.24
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.29□□□□□ -1.24
SNORD116-28-201ENST00000516123 SOX12O15370 315 aa7.28□□□□□ -1.24
SNORD116-28-201ENST00000516123 MICALL2Q8IY33 904 aa7.28□□□□□ -1.24
SNORD116-28-201ENST00000516123 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 PTGER2P43116 358 aa7.23□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.23□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.22□□□□□ -1.25
SNORD116-28-201ENST00000516123 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.22□□□□□ -1.25
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