RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.01■□□□□ 0.31
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PGGT1B-205ENST00000514178 AKT1S1Q96B36 256 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.98■□□□□ 0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
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PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.94■□□□□ 0.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 FAM212AQ96EL1 285 aa16.92■□□□□ 0.3
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PGGT1B-205ENST00000514178 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.73■□□□□ 0.27
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1B-205ENST00000514178 STK24Q9Y6E0 443 aa16.68■□□□□ 0.26
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PGGT1B-205ENST00000514178 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.34■□□□□ 0.21
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PGGT1B-205ENST00000514178 WDR70Q9NW82 654 aa16.25■□□□□ 0.19
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PGGT1B-205ENST00000514178 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-205ENST00000514178 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R37O75864 691 aa16.1■□□□□ 0.17
PGGT1B-205ENST00000514178 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.09■□□□□ 0.17
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PGGT1B-205ENST00000514178 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1B-205ENST00000514178 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.94■□□□□ 0.14
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.92■□□□□ 0.14
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PGGT1B-205ENST00000514178 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-205ENST00000514178 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA3EO15041 775 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF12Q96QT6 1004 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE4AP27815 886 aa15.81■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 MFSD10Q14728 455 aa15.8■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.77■□□□□ 0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA2Q08379 1002 aa15.76■□□□□ 0.11
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PGGT1B-205ENST00000514178 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPC6Q9Y210 931 aa15.71■□□□□ 0.11
PGGT1B-205ENST00000514178 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PGGT1B-205ENST00000514178 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMK2BQ13554 666 aa15.68■□□□□ 0.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.68■□□□□ 0.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.68■□□□□ 0.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.68■□□□□ 0.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.67■□□□□ 0.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMYND10O75800 440 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-205ENST00000514178 NEUROD2Q15784 382 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-205ENST00000514178 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 TIE1P35590 1138 aa15.56■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 BARGINQ6ZT62 677 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 C14orf37Q86TY3 774 aa15.52■□□□□ 0.08
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