RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 PLEKHG5O94827 1062 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC3-209ENST00000504994 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
HERC3-209ENST00000504994 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-209ENST00000504994 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HERC3-209ENST00000504994 GSE1Q14687 1217 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-209ENST00000504994 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-209ENST00000504994 NUBP1P53384 320 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-209ENST00000504994 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-209ENST00000504994 STK25O00506 426 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-209ENST00000504994 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-209ENST00000504994 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HERC3-209ENST00000504994 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-209ENST00000504994 FAM212AQ96EL1 285 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 STK24Q9Y6E0 443 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 ARXQ96QS3 562 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 P3H3Q8IVL6 736 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 CREBZFQ9NS37 354 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-209ENST00000504994 RASEFQ8IZ41 740 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 PYGBP11216 843 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-209ENST00000504994 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-209ENST00000504994 C14orf37Q86TY3 774 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-209ENST00000504994 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-209ENST00000504994 PRR29P0C7W0 189 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-209ENST00000504994 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-209ENST00000504994 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
HERC3-209ENST00000504994 WDR70Q9NW82 654 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-209ENST00000504994 HOMEZQ8IX15 550 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-209ENST00000504994 AKT1S1Q96B36 256 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-209ENST00000504994 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 MFRPQ9BY79 579 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 NEUROD2Q15784 382 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-209ENST00000504994 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 SEMA3EO15041 775 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R37O75864 691 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 E2F4Q16254 413 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-209ENST00000504994 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-209ENST00000504994 PITPNM1O00562 1244 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-209ENST00000504994 PSEN1P49768 467 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-209ENST00000504994 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-209ENST00000504994 ZMYND10O75800 440 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-209ENST00000504994 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HERC3-209ENST00000504994 CHADLQ6NUI6 762 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 NLRP6P59044 892 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 CABP2Q9NPB3 220 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HERC3-209ENST00000504994 SOX12O15370 315 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 BARGINQ6ZT62 677 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 IFNL1Q8IU54 200 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 MFSD10Q14728 455 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.38□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-209ENST00000504994 PDE4AP27815 886 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.33□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 MAP3K13O43283 966 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 CAMK2BQ13554 666 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 AK7Q96M32 723 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 IL27Q8NEV9 243 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 KIF12Q96FN5 646 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-209ENST00000504994 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 ZMYND15Q9H091 742 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 TRIM66O15016 1216 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 PDE4DQ08499 809 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-209ENST00000504994 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.21□□□□□ -0.94
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